在PCR實(shí)驗(yàn)室中,DNA污染很難清除。即使只有一個(gè)污染的DNA分子被檢測(cè)到,也會(huì)使整個(gè)PCR檢測(cè)過程出現(xiàn)誤差。為確保PCR試驗(yàn)數(shù)據(jù)準(zhǔn)確,預(yù)防DNA或RNA交叉污染,PCR實(shí)驗(yàn)室大多會(huì)常備DNA/RNA污染清除劑。德國MB公司生產(chǎn)的PCR Clean特點(diǎn):
1.可有效地降解大多數(shù)表面上(輕質(zhì)金屬或有色金屬除外)的擴(kuò)增子,質(zhì)粒或基因組DNA和RNA。該產(chǎn)品還能有效地去除DNA酶和RNA酶。
2.可直接使用。
3.保護(hù)實(shí)驗(yàn)人員,避免接觸DNA污染。
4.非堿性,無致癌性,成分安全。
DNA復(fù)制使生命王國之間的基因遺傳成為可能。復(fù)制的發(fā)生有一個(gè)確定的時(shí)間順序,即復(fù)制時(shí)間(RT)程序,導(dǎo)致基因組組織成早期或晚期復(fù)制區(qū)域。RT是細(xì)胞類型特異性的,與基因組的三維核組織緊密相連,被認(rèn)為是一種表觀遺傳指紋。
盡管RT在維持表觀基因組方面具有重要意義,但其在哺乳動(dòng)物體內(nèi)的發(fā)育調(diào)控尚未被探索。在這里,科研人員使用單細(xì)胞Repli-seq5,生成了小鼠胚胎從受精卵到囊胚期的全基因組RT圖譜。數(shù)據(jù)顯示,RT最初不明確,但從4細(xì)胞期開始逐漸明確,與A和B區(qū)室的強(qiáng)化相一致。我們發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄有助于RT程序的準(zhǔn)確性,并且A和B區(qū)室之間RT的差異取決于合子基因組激活時(shí)的RNA聚合酶II。
研究數(shù)據(jù)表明,核組織的建立先于定義的RT特征的獲得,并啟動(dòng)基因組劃分為早期和晚期復(fù)制結(jié)構(gòu)域。該項(xiàng)研究工作揭示了哺乳動(dòng)物發(fā)育初期表觀基因組的建立,揭示了基因組組織的組織原則。相關(guān)研究發(fā)表在《Nature》上,文章標(biāo)題為:“Emergence of replication timing during early mammalian development"。